З початку XVII ст. османська влада
збільшила податки і побори на користь місцевих феодалів, що викликало
хвилювання серед албанських селян. У 1645 і 1649 рр. турецькі правителі
придушили змови і бунти, організовані католицькими лідерами в прибережних
містах під час війни з Венецією. Різні північні племена співпрацювали з австрійськими
і венеціанськими військами під час кількох воєн, що відбувалися між 1683 і 1739
рр., тому турки посилили тиск на албанських католиків, примушуючи їх прийняти
мусульманство. У XVIII ст. вплив
Османської імперії послаблюється. Тисячі сербів після 1690 р. залишили
Косовську рівнину, частково побоюючись репресій з боку турків. У цей час
впливовими стають деякі родини землевласників, які стягували податки з селян.
Шкодерські паші Бушаті правили на
півночі і в центрі країни, а під час наполеонівських воєн і в подальший період Алі-паша Тепелена (1744-1822) заснував
напівнезалежну державу в південній Албанії, Епірі і західній Македонії. Султан Махмуд II, що прагнув централізувати і
зміцнити Османську державу, розгромив у 1820-1822 рр. війська Алі-паші, а в
1831 р. пашів Бушаті. У 1830-х рр. менш відомі представники албанських вельмож
виступили проти турків, але
реорганізована османська армія обстріляла їхні замки і змусила підкоритися.
Реформи 1826-1856 рр., що затвердили регулярну виплату податків, заклик на
військову службу в мирний час і призначення чиновників неалбанського походження
зустріли відсіч і виявилися ефективними тільки в південній Албанії. Опір переріс у національний рух, що посилився після 1878 року. Розпад Османської імперії і прагнення
балканських народів до незалежності вперше отримали відгук в Албанії після
російсько-турецької війни 1877-1878 рр. На Берлінському конгресі великі
держави, як одну з умов мирного договору, запропонували передати Сербії і
Чорногорії райони північної Албанії. Проти цього рішення виступили деякі
албанські вожді і представники знаті (в основному мусульмани), які організували
Албанську, або Призрекську лігу. Спочатку вона підтримувалася османським
урядом, збирала кошти, вербувала озброєних бійців і готувалася до боротьби.
Ліга набула більш націоналістичного і незалежного характеру після приєднання
католицьких племен зі Шкодера і православних - з півдня. У 1879-1880 рр. було
дано відсіч спробам поступитися навіть незначними територіями Чорногорії, і Ліга
погодилася на передачу району Улцинь Чорногорії у 1880 р. лише після того, як
турецька армія завдала поразки албанцям. Південне відділення Ліги рішуче
відкидало зазіхання Греції на території, населені албанцями в Епірі. Виникли побоювання, що після остаточного розпаду Османської
імперії Албанія може бути розділеною на частини сусідніми державами. Аби цьому
запобігти, Ліга зажадала об'єднання албанських округів в одну автономну
провінцію з тим, щоб управління, шкільну освіту і збір податків контролювали
самі албанці. Така національна програма призвела до розколу Ліги: мусульмани
центральної Албанії виступили проти програми, зберігши вірність
Константинополю. Розлютився і султан, який направив у 1881 р. війська для
придушення Ліги: деякі з її керівників були заарештовані, інших туркам вдалося
схилити на свій бік.